Table 3 Differentially expressed genes in IA tissue present within IA risk associated TADs
| Â | HUVEC TAD | Fib. (IMR90) TAD | ||
|---|---|---|---|---|
Gene (TAD found in) | IA versus Ctr | R versus UR | IA versus Ctr | R versus UR |
BFSP1 (rs1132274) |  |  |  | Kleinloog (↓, − 4.0) |
|  |  |  | Nakaoka (↓, − 1.8) | |
CASD1 (rs42524) |  | Kurki (↓, − 1.0) |  |  |
CDKN2A (rs2891168, rs10757278) | Wang (↑, NR) | Nakaoka (↓, − 1.9) | Wang (↑, NR) | Nakaoka (↓, − 1.9) |
CDKN2B (rs2891168, rs10757278) | Wang (↑, NR) |  | Wang (↑, NR) |  |
COL1A2 (rs42524) | Li (↑, NR) |  | Li (↑, NR) |  |
Wang (↑, NR) |  | Wang (↑, NR) |  | |
COL3A1 (rs1800255) | Li (↑, NR) |  | Li (↑, NR) |  |
Wang (↑, NR) |  | Wang (↑, NR) |  | |
COL5A2 (rs1800255) | Li (↑, NR) |  |  |  |
Shi (↑, 3.3) |  |  |  | |
Wang (↑, NR) |  |  |  | |
DSTN (rs1132274) |  |  | Wang (↓, NR) |  |
GULP1 (rs1800255) |  | Kurki (↓, − 2.2) |  | Kurki (↓, − 2.2) |
|  | Nakaoka (↓, − 1.3) |  | Nakaoka (↓, − 1.3) | |
IL6 (rs1800796) |  | Kurki (↑, 2.2) |  | Kurki (↑, 2.2) |
KLHL7 (rs1800796) |  | Nakaoka (↑, 0.50) |  | Nakaoka (↑, 0.50) |
MEOX2 (rs4628172) | Wang (↓, NR) |  | Wang (↓, NR) |  |
MOB4 (rs1429412) | Wang (↓, NR) |  | Wang (↓, NR) |  |
PDK4 (rs42524) | Wang (↓, NR) | Kurki (↑, 1.0) |  |  |
PLCL1 (rs700651) |  | Kleinloog (↓, − 4.0) |  | Kleinloog (↓, − 4.0) |
|  | Kurki (↓, − 1.4) |  | Kurki (↓, − 1.4) | |
PPP1R9A (rs42524) | Wang (↓, NR) |  |  |  |
RRBP1 (rs1132274) |  |  | Wang (↑, NR) |  |
SGCE (rs42524) | Wang (↓, NR) | Kurki (↓, − 2.3) |  |  |
SNX5 (rs1132274) |  |  | Wang (↑, NR) |  |
SOX17 (rs10958409, rs9598506) | Wang (↓, NR) | Nakaoka (↑, 0.88) |  |  |
TFPI (rs1800255) |  |  | Wang (↓, NR) |  |
TMEM167A (rs251124) |  | Kurki (↑, 1.2) |  | Kurki (↑, 1.2) |
TOMM7 (rs1800796) |  | Kurki (↓, − 0.86) |  | Kurki (↓, − 0.86) |
VCAN (rs251124) | Shi (↑, 2.9) |  | Shi (↑, 2.9) |  |
Wang (↑, NR) |  | Wang (↑, NR) |  | |
XRCC4 (rs251124) |  | Kleinloog (↑, 2.3) |  | Kleinloog (↑, 2.3) |